Väitös teollisesti tärkeiden tuotanto-organismien aineenvaihdunnasta
01.12.2009
VTT:n Metabolian muokkaus –tiimin tutkija, diplomi-insinööri Paula Jouhten väittelee 3.12.2009 Teknillisessä korkeakoulusta. Väitöskirja käsittelee aineenvaihdunnan mallinnusta ja vuoanalyysia ja niiden sovelluksia bioteknologian tuotanto-organismeille.
Vuot ovat tuotanto-organismin eli solutehtaan prosessivirtoja.
Prosessivirtojen määrittäminen on tärkeää tuotannon ohjauksen kannalta.
Toisaalta vuot ovat myös organismin monimutkaisten säätelymekanismien tuottama
ilmiasu.
Solunsisäisten vaihtoehtoisten
aineenvaihduntareittien prosessivirtoja ei kuitenkaan ole mahdollista suoraan
mitata, vaan ne on määritettävä leimauskokeiden, mallinnuksen ja
laskennallisen analyysin avulla. Leimauskokeissa tarkastellaan hiilen
stabiilin isotoopin, 13C, jakaumia aineenvaihduntatuotteissa.
Väitöskirjatutkimuksessa
mallinnettiin tuotanto-organismien, Saccharomyces cerevisiae ja Pichia
pastoris -hiivojen ja Trichoderma reesei -homeen aineenvaihduntaa,
suoritettiin 13C-leimauskokeita tuotantoprosessien kannalta mielenkiintoisissa
olosuhteissa ja määritettiin solunsisäisten prosessivirtojen
olosuhderiippuvuuksia. Aineenvaihduntatuotteiden 13C-jakaumia määritettiin
ydinmagneettisen resonanssispektroskopian (NMR-spektroskopian) menetelmin.
NMR-spektroskopiaa sovellettiin myös homeen erään aineenvaihduntareitin mallin
validointiin. Varsinkin S. cerevisiae -hiiva on lisäksi tärkeä
malliorganismi, jonka ilmiasun säätelystä voidaan johtaa informaatiota myös
korkeampien solujen, kuten ihmissolujen toiminnan ymmärtämiseen.
Diplomi-insinööri
Paula Jouhtenin väitös ”Metabolic modelling and 13C flux analysis -
application to biotechnologically important yeasts and a fungus
(Aineenvaihdunnan mallinnus ja 13C-vuoanalyysi-sovellukset bioteknologisesti
tärkeisiin hiivoihin ja homeeseen)” tarkastetaan torstaina 3.12.2009 klo 12
Teknillisessä korkeakoulussa (Otakaari 3, Teknillisen fysiikan talon
auditorio).
