Lähetä linkki
Väitös: Biologisesta mittausdatasta hyödyllistä tietoa sairauksien alkuprosessien tutkimiseen
10.05.2010
Mittaustekniikat ovat kehittyneet nopeasti ja tuottavat suuren määrän käyttökelpoista biologista dataa. Datan suuri koko ja monimutkaisuus ovat luoneet uusia haasteita biologian tutkimukselle. Aluksi tulee luoda järjestelmä datan säilöntää ja käsittelyä varten. Sen jälkeen data on muutettava biologiseksi tiedoksi älykkäiden tiedonkäsittelymenetelmien avulla. VTT:n tutkija Gopal Peddinti on kehittänyt väitöstyössään heterogeenisen biologisten datan käsittelymenetelmiä tietämyksen jalostamiseksi.
Peddintin tutkimus on toteutettu systeemibiologian keinoin. Systeemibiologia
on monitieteellinen tutkimusalue, joka hyödyntää biologian, fysiikan ja
kemian, tietojenkäsittelytieteen sekä matematiikan tietämystä. Viimeisten
vuosikymmenten aikana on kehitetty uusia kokeellisia menetelmiä, jotka
tuottavat suuria määriä hyödyllistä tietoa.
Väitöstyössä
kehitettyjä menetelmiä on sovellettu moniin biologisiin tutkimuksiin,
Esimerkiksi siinä on tutkittu, miten Saccharomyces cerevisiae -hiiva reagoi
oksidatiiviseen stressiin. Oksidatiivinen stressi on ilmiö, joka on liitetty
useiden metabolisten sairauksien (esim. sydän- ja verisuonisairaudet, syöpä)
syntyyn.
Väitöstyö on jo johtanut biologisen informaation
visualisointiin liittyvään patenttiin (WO/2006/114479, 2.11.2006).
Gopal
Peddinti väittelee aiheesta ”Data integration, pathway analysis and mining for
systems biology” perjantaina 14.5.2010 klo 12 Aalto-yliopiston teknillisessä
korkeakoulussa (Otakaari 3).
Väitösjulkaisu