Lähetä linkki
Väitös: Verkkobiologian työkaluja lääketieteen ja biotekniikan sovelluksiin
02.11.2011
VTT:n tutkija, diplomi-insinööri Erno Lindfors väittelee aiheesta ”Verkkobiologia. Lääketieteellisiä ja bioteknisiä sovelluksia” 4.11.2011 klo 12 Aalto-yliopistossa. Tutkimuksella on ollut keskeinen rooli VTT:n bioinformatiikka-arkkitehtuurin pystyttämisessä, ja se on johtanut biologisen tiedon visualisointitekniikan patenttiin. Väitöstyö on tehty tutkimusprofessori Matej Orešičin alaisuudessa VTT:n kvantitatiivisen biologian ja bioinformatiikan ryhmässä.
Tutkimustyössä kehitettiin biologisen tiedon visualisointityökalu, joka
hyödyntää useasta eri lähteestä yhdistettyä biologista mittaustietoa. Lisäksi
kehitettiin kaksi verkkoteoreettista menetelmää, joiden hyödyllisyys
osoitettiin lääketieteellisin ja bioteknisin sovelluksin.
Merkittävimpänä
löydöksenä havaittiin, että mahdollisesti haiman tuhoutumista hapettavalta
kuormitukselta estävä aineenvaihduntareaktiopolku oli alisäädelty tyypin 1
diabeteksen varhaisessa vaiheessa laihojen diabeteshiirien mallissa. Löydös on
yhteensopiva viimeaikaisten kliinisten tutkimustulosten kanssa.
Verkkobiologiassa
käytetään verkkoteoreettisia matemaattisia menetelmiä monimutkaisten
biologisten vuorovaikutusten mallintamiseen, mikä on viime vuosina johtanut
moniin käytännön sovelluksiin aina sairauksien selventämisestä
bioteknologiaan. Menetelmät hyödyntävät valtavaa biologisen tiedon määrää,
mikä on seurausta viimeisen vuosikymmenen aikana tapahtuneesta biologisen
tiedon mittausmenetelmien nopeasta kehityksestä. Tietoa ovat tuottaneet
tuhannet eri tutkimusryhmät, joten se sijaitsee useissa eri tietokannoissa.
Erno
Lindforsin väitöstilaisuus pidetään 4.11.2011 klo 12 Aalto-yliopiston
teknillisessä korkeakoulussa (E-sali, Otakaari 1, Espoo). Väitöstilaisuuden
kustoksena toimii professori Kimmo Kaski Aalto-yliopiston perustieteiden
korkeakoulusta, ja vastaväittäjänä professori Olli Yli-Harja Tampereen
teknillisestä yliopistosta.